Na zijn afstuderen is Eelco de Jong zijn loopbaan gestart bij een aantal gemeenten om vervolgens als senior-secretaris bij de rechtbank te gaan werken. Alvorens als advocaat bij Nysingh advocaten-notarissen in dienst te treden, is Eelco een aantal jaren docent aan de Hogeschool voor Economische Studies in Rotterdam geweest. Als advocaat heeft Eelco met name een bestuursrechtelijke praktijk. Eelco heeft veelvuldig overheden en zorginstellingen bijgestaan.